Chủ mưu trong vụ án được xác định là là Trần Khắc Hùng (cựu Chủ tịch HĐQT kiêm Viện trưởng viện Đào tạo liên tục, viện trưởng Viện Đào tạo và Phát triển công nghệ 4.0).
Bị can Hùng và các đồng phạm đã lợi dụng những sơ hở, thiếu sót trong công tác quản lý việc tuyển sinh, đào tạo, cấp bằng đối với hệ văn bằng 2; lợi dụng chính sách tự chủ giáo dục đại học để thực hiện hành vi vi phạm pháp luật. Hiện bị can Trần Khắc Hùng bỏ trốn, đang bị truy nã, do đó cơ quan an ninh điều tra đã tạm đình chỉ điều tra vụ án, tạm đình chỉ điều tra bị can đối với Trần Khắc Hùng.
Theo kết luận điều tra, từ tháng 4/2017, Hùng chỉ đạo Trần Kim Oanh (cựu Phó Hiệu trưởng kiêm Phó viện trưởng, viện Đào tạo liên tục) và Dương Văn Hòa (cựu Hiệu trưởng) ký thông báo tuyển sinh văn bằng 2 tiếng Anh gửi các cơ sở, cá nhân, đồng thời ký hợp đồng hỗ trợ tuyển sinh, đào tạo văn bằng 2 tiếng Anh với 15 cơ sở đào tạo.
Cơ quan an ninh điều tra xác định, ngoài các lần hợp thức hóa hồ sơ, tài liệu để cấp bằng giả cho 118 cá nhân, trường Đại học Đông Đô đã cấp 193 bằng cử nhân ngành ngôn ngữ tiếng Anh giả cho các cá nhân, không qua tuyển sinh, đào tạo hoặc chưa đủ điều kiện cấp bằng.
